Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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FOXE3Q13461 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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