Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL49Q13405 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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