Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CLN3Q13286 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLN3Q13286 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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