Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1H3Q13133 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1H3Q13133 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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