Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXF2Q12947 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXF2Q12947 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms