Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNMA1Q12791 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.4 ms