Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRXP46100 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRXP46100 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRXP46100 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRXP46100 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRXP46100 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRXP46100 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRXP46100 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRXP46100 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRXP46100 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms