Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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HCN4Q9Y3Q4 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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HCN4Q9Y3Q4 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN4Q9Y3Q4 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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HCN4Q9Y3Q4 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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HCN4Q9Y3Q4 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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HCN4Q9Y3Q4 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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HCN4Q9Y3Q4 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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HCN4Q9Y3Q4 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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HCN4Q9Y3Q4 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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HCN4Q9Y3Q4 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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