Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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