Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD1Q16676 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD1Q16676 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD1Q16676 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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