Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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