Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms