Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SYCP1Q15431 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYCP1Q15431 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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