Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RYR3Q15413 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200 ms