Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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BRD3Q15059 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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BRD3Q15059 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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BRD3Q15059 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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BRD3Q15059 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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BRD3Q15059 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
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BRD3Q15059 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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BRD3Q15059 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BRD3Q15059 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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BRD3Q15059 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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BRD3Q15059 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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