Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKP1Q13835 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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