Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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