Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF3Q13114 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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