Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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