Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
BPTFQ12830 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.79□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
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BPTFQ12830 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
BPTFQ12830 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
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