Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
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HOXC5Q00444 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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