Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMG1Q96Q15 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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