Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYDE1Q6ZW31 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYDE1Q6ZW31 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms