Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf53Q5VUE5 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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C1orf53Q5VUE5 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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C1orf53Q5VUE5 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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C1orf53Q5VUE5 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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C1orf53Q5VUE5 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
C1orf53Q5VUE5 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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