Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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ANKRD39Q53RE8 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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ANKRD39Q53RE8 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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ANKRD39Q53RE8 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ANKRD39Q53RE8 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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