Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
MSMPQ1L6U9 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSMPQ1L6U9 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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