Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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