Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGA3Q16281 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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