Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
E2F4Q16254 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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