Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USF2Q15853 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USF2Q15853 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USF2Q15853 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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