Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIP4Q15650 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIP4Q15650 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIP4Q15650 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms