Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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BRD3Q15059 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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BRD3Q15059 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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BRD3Q15059 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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BRD3Q15059 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BRD3Q15059 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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