Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
MLC1Q15049 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
MLC1Q15049 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MLC1Q15049 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.4 ms