Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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GBX1Q14549 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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GBX1Q14549 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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GBX1Q14549 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GBX1Q14549 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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GBX1Q14549 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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GBX1Q14549 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
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GBX1Q14549 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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GBX1Q14549 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
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GBX1Q14549 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GBX1Q14549 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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