Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A3Q14050 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A3Q14050 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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