Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCINQ13939 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCINQ13939 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCINQ13939 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCINQ13939 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCINQ13939 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCINQ13939 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCINQ13939 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCINQ13939 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCINQ13939 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CCINQ13939 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCINQ13939 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CCINQ13939 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCINQ13939 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCINQ13939 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCINQ13939 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCINQ13939 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCINQ13939 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCINQ13939 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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