Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H3Q13889 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H3Q13889 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF2H3Q13889 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280 ms