Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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