Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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