Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LSAMPQ13449 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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