Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NR1H3Q13133 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1H3Q13133 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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