Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1AQ13111 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1AQ13111 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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