Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP4Q13107 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
USP4Q13107 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
USP4Q13107 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP4Q13107 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP4Q13107 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP4Q13107 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP4Q13107 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP4Q13107 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP4Q13107 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP4Q13107 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP4Q13107 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP4Q13107 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP4Q13107 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP4Q13107 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP4Q13107 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP4Q13107 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP4Q13107 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP4Q13107 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP4Q13107 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP4Q13107 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP4Q13107 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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USP4Q13107 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP4Q13107 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP4Q13107 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP4Q13107 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP4Q13107 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP4Q13107 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP4Q13107 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP4Q13107 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP4Q13107 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP4Q13107 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP4Q13107 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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USP4Q13107 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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USP4Q13107 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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USP4Q13107 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP4Q13107 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP4Q13107 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP4Q13107 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP4Q13107 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP4Q13107 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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USP4Q13107 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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USP4Q13107 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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USP4Q13107 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP4Q13107 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP4Q13107 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP4Q13107 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP4Q13107 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP4Q13107 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
USP4Q13107 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
USP4Q13107 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
USP4Q13107 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP4Q13107 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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