Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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