Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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TRAF1Q13077 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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TRAF1Q13077 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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TRAF1Q13077 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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TRAF1Q13077 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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TRAF1Q13077 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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TRAF1Q13077 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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TRAF1Q13077 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF1Q13077 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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