Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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