Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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RABGGTBP53611 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTBP53611 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTBP53611 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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RABGGTBP53611 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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RABGGTBP53611 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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RABGGTBP53611 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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RABGGTBP53611 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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