Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC5Q9UII4 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC5Q9UII4 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177 ms