Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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