Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TIMMDC1Q9NPL8 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TIMMDC1Q9NPL8 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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